Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
VPREB3Q9UKI3 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
VPREB3Q9UKI3 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
VPREB3Q9UKI3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.4 ms