Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI09

NDUFA12, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 12, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA12Q9UI09 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NDUFA12Q9UI09 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
NDUFA12Q9UI09 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms