Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHL9

GTF2IRD1, General transcription factor II-I repeat domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 959 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IRD1Q9UHL9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GTF2IRD1Q9UHL9 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GTF2IRD1Q9UHL9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GTF2IRD1Q9UHL9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.8 ms