Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
DKK2Q9UBU2 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
DKK2Q9UBU2 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms