Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2J9

PDP2, [Pyruvate dehydrogenase [acetyl-transferring]]-phosphatase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDP2Q9P2J9 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PDP2Q9P2J9 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
PDP2Q9P2J9 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PDP2Q9P2J9 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms