Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
IL1RAPQ9NPH3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
IL1RAPQ9NPH3 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.6 ms