Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
SLC40A1Q9NP59 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC40A1Q9NP59 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC40A1Q9NP59 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.9 ms