Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0M0

WWP1, NEDD4-like E3 ubiquitin-protein ligase WWP1, humanhuman

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WWP1Q9H0M0 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
WWP1Q9H0M0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
WWP1Q9H0M0 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms