Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0D0

PHACTR1, Phosphatase and actin regulator 1, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR1Q9C0D0 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
PHACTR1Q9C0D0 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PHACTR1Q9C0D0 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms