Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 GAS2-202ENST00000454584 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
SNHG12Q9BXW3 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
SNHG12Q9BXW3 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms