Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSF4

TIMM29, Mitochondrial import inner membrane translocase subunit Tim29, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TIMM29Q9BSF4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TIMM29Q9BSF4 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TIMM29Q9BSF4 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
TIMM29Q9BSF4 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms