Protein–RNA interactions for Protein: Q99961

SH3GL1, Endophilin-A2, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3GL1Q99961 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
SH3GL1Q99961 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SH3GL1Q99961 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms