Protein–RNA interactions for Protein: Q99471

PFDN5, Prefoldin subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN5Q99471 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PFDN5Q99471 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
PFDN5Q99471 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms