Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ERGIC2Q96RQ1 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ERGIC2Q96RQ1 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ERGIC2Q96RQ1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
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