Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
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SAMD8Q96LT4 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
SAMD8Q96LT4 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
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SAMD8Q96LT4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SAMD8Q96LT4 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SAMD8Q96LT4 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
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SAMD8Q96LT4 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
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SAMD8Q96LT4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
SAMD8Q96LT4 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
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