Protein–RNA interactions for Protein: Q96EX1

SMIM12, Small integral membrane protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM12Q96EX1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMIM12Q96EX1 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
SMIM12Q96EX1 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms