Protein–RNA interactions for Protein: Q96EB6

SIRT1, NAD-dependent protein deacetylase sirtuin-1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIRT1Q96EB6 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
SIRT1Q96EB6 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.82■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC31.81■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
SIRT1Q96EB6 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC31.73■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC31.72■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC31.72■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC31.71■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.67
SIRT1Q96EB6 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms