Protein–RNA interactions for Protein: Q96D46

NMD3, 60S ribosomal export protein NMD3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NMD3Q96D46 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NMD3Q96D46 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMD3Q96D46 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NMD3Q96D46 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NMD3Q96D46 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NMD3Q96D46 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
NMD3Q96D46 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMD3Q96D46 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMD3Q96D46 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NMD3Q96D46 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NMD3Q96D46 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NMD3Q96D46 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
NMD3Q96D46 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMD3Q96D46 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMD3Q96D46 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMD3Q96D46 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NMD3Q96D46 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NMD3Q96D46 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NMD3Q96D46 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
NMD3Q96D46 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMD3Q96D46 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMD3Q96D46 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
NMD3Q96D46 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
NMD3Q96D46 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMD3Q96D46 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMD3Q96D46 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMD3Q96D46 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
NMD3Q96D46 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
NMD3Q96D46 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms