Protein–RNA interactions for Protein: Q96D15

RCN3, Reticulocalbin-3, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCN3Q96D15 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RCN3Q96D15 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RCN3Q96D15 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
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