Protein–RNA interactions for Protein: Q96AA3

RFT1, Protein RFT1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFT1Q96AA3 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
RFT1Q96AA3 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RFT1Q96AA3 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms