Protein–RNA interactions for Protein: Q92731

ESR2, Estrogen receptor beta, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR2Q92731 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ESR2Q92731 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ESR2Q92731 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ESR2Q92731 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ESR2Q92731 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ESR2Q92731 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ESR2Q92731 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.3 ms