Protein–RNA interactions for Protein: Q8TBR4

STAG3L4, Putative STAG3-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAG3L4Q8TBR4 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
STAG3L4Q8TBR4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
STAG3L4Q8TBR4 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
STAG3L4Q8TBR4 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms