Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4S0

CCDC82, Coiled-coil domain-containing protein 82, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC82Q8N4S0 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
CCDC82Q8N4S0 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
CCDC82Q8N4S0 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms