Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV31

TMEM139, Transmembrane protein 139, humanhuman

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM139Q8IV31 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TMEM139Q8IV31 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TMEM139Q8IV31 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1648.5 ms