Protein–RNA interactions for Protein: Q7L1S5

CHST9, Carbohydrate sulfotransferase 9, humanhuman

Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHST9Q7L1S5 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CHST9Q7L1S5 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CHST9Q7L1S5 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CHST9Q7L1S5 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.9 ms