Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT89

SLC25A48, Solute carrier family 25 member 48, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A48Q6ZT89 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A48Q6ZT89 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A48Q6ZT89 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A48Q6ZT89 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SLC25A48Q6ZT89 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
SLC25A48Q6ZT89 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms