Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3X3

TTC27, Tetratricopeptide repeat protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC27Q6P3X3 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TTC27Q6P3X3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TTC27Q6P3X3 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC27Q6P3X3 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TTC27Q6P3X3 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.8 ms