Protein–RNA interactions for Protein: Q6NTE8

MRNIP, MRN complex-interacting protein, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRNIPQ6NTE8 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
MRNIPQ6NTE8 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
MRNIPQ6NTE8 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.6 ms