Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUM1

SDHAF4, Succinate dehydrogenase assembly factor 4, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF4Q5VUM1 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
SDHAF4Q5VUM1 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SDHAF4Q5VUM1 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SDHAF4Q5VUM1 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SDHAF4Q5VUM1 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDHAF4Q5VUM1 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SDHAF4Q5VUM1 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDHAF4Q5VUM1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SDHAF4Q5VUM1 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms