Protein–RNA interactions for Protein: Q59H18

TNNI3K, Serine/threonine-protein kinase TNNI3K, humanhuman

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3KQ59H18 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
TNNI3KQ59H18 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
TNNI3KQ59H18 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
TNNI3KQ59H18 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms