Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJI4

SLC9B1, Sodium/hydrogen exchanger 9B1, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9B1Q4ZJI4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SLC9B1Q4ZJI4 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SLC9B1Q4ZJI4 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms