Protein–RNA interactions for Protein: Q3C1V9

Putative uncharacterized protein ENSP00000334305, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3C1V9 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Q3C1V9 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q3C1V9 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q3C1V9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Q3C1V9 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Q3C1V9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Q3C1V9 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q3C1V9 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q3C1V9 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q3C1V9 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Q3C1V9 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Q3C1V9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Q3C1V9 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Q3C1V9 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.76
Q3C1V9 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q3C1V9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Q3C1V9 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q3C1V9 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Q3C1V9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q3C1V9 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Q3C1V9 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AC012313.1-204ENST00000444227 462 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Q3C1V9 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Q3C1V9 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q3C1V9 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q3C1V9 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q3C1V9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Q3C1V9 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Q3C1V9 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms