Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

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Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC34.2■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
NCOA1Q15788 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC34.2■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
NCOA1Q15788 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC34.13■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NCOA1Q15788 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
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