Protein–RNA interactions for Protein: Q15365

PCBP1, Poly(rC)-binding protein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCBP1Q15365 PDLIM7-211ENST00000504318 597 ntTSL 315.56■□□□□ 0.084e-10■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SEPT9-232ENST00000590825 554 ntTSL 415.55■□□□□ 0.082e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AC007388.1-204ENST00000449569 2517 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.072e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AC007388.1-205ENST00000445520 499 ntTSL 215.45■□□□□ 0.062e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-244ENST00000532952 773 ntTSL 315.17■□□□□ 0.022e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.011e-9■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 CLSTN1-205ENST00000477264 2169 ntTSL 215.11■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-206ENST00000409754 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.012e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -01e-9■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -01e-9■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-210ENST00000475329 544 ntTSL 314.88□□□□□ -0.034e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.031e-8■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ARHGAP33-206ENST00000587447 2983 ntTSL 1 (best)14.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 SEPT9-242ENST00000592098 503 ntTSL 414.84□□□□□ -0.032e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.042e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.041e-9■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IMPDH1-207ENST00000469328 2295 ntTSL 514.76□□□□□ -0.051e-9■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PRR12-203ENST00000615927 4479 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.065e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ACBD4-211ENST00000589798 494 ntTSL 514.64□□□□□ -0.072e-6■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 KANSL1-221ENST00000638902 1971 ntTSL 214.34□□□□□ -0.112e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AP2A2-213ENST00000528815 3072 ntTSL 214.21□□□□□ -0.132e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.142e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-222ENST00000556733 510 ntTSL 514.12□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IMPDH1-211ENST00000484496 2422 ntTSL 514.1□□□□□ -0.151e-9■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-216ENST00000555533 1605 ntTSL 1 (best)14.09□□□□□ -0.152e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AC007388.1-207ENST00000446698 593 ntTSL 513.98□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IGF1R-212ENST00000560186 551 ntTSL 413.97□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AP2A2-202ENST00000448903 4575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.172e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AC010997.3-201ENST00000418818 502 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 ACBD4-212ENST00000590289 876 ntTSL 313.66□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TRAF4-202ENST00000262396 683 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.234e-7■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 LIMS2-210ENST00000413578 930 ntTSL 313.59□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-217ENST00000603409 842 ntTSL 513.59□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PTPRF-215ENST00000496447 5887 ntTSL 1 (best)13.41□□□□□ -0.262e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 INTS11-246ENST00000534345 485 ntTSL 413.3□□□□□ -0.282e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-214ENST00000603187 3713 ntTSL 1 (best)13.27□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.292e-6■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 CAPN1-202ENST00000524773 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.341e-8■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 UBAP2L-206ENST00000428595 1419 ntTSL 1 (best)12.85□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ARHGAP33-204ENST00000378944 4219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.352e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 RTN2-203ENST00000430715 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.362e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 PTPRF-205ENST00000414879 4836 ntTSL 212.67□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-212ENST00000492395 4490 ntTSL 1 (best)12.66□□□□□ -0.382e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IGF1R-204ENST00000558355 572 ntTSL 212.59□□□□□ -0.392e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 CUL7-201ENST00000265348 5254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.54□□□□□ -0.42e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-202ENST00000412198 3611 ntTSL 212.45□□□□□ -0.422e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 CAPN1-208ENST00000527323 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.421e-8■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-224ENST00000557550 1529 ntTSL 512.39□□□□□ -0.432e-6■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 QSOX1-202ENST00000367602 9311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.442e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 GPX3-204ENST00000520059 316 ntTSL 312.12□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TSPAN9-201ENST00000011898 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.472e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 RTN2-205ENST00000588036 546 ntTSL 411.8□□□□□ -0.522e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-222ENST00000604754 3369 ntTSL 1 (best)11.73□□□□□ -0.532e-6■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 SLC7A1-201ENST00000380752 7347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.552e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-211ENST00000554849 915 ntTSL 511.54□□□□□ -0.562e-6■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 UBAP2L-207ENST00000428931 3988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 IGF1R-203ENST00000557938 574 ntTSL 410.96□□□□□ -0.652e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-218ENST00000603840 970 ntTSL 1 (best)10.88□□□□□ -0.672e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 UBAP2L-216ENST00000484819 1056 ntTSL 210.85□□□□□ -0.671e-17■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-203ENST00000553389 952 ntTSL 210.72□□□□□ -0.692e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 CLSTN1-203ENST00000435891 3829 ntTSL 210.59□□□□□ -0.712e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 RTN2-209ENST00000590746 228 ntTSL 310.55□□□□□ -0.722e-6■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 OTUD7B-202ENST00000581312 8872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.762e-6■■■■■ 32.7
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PCBP1Q15365 IGF1R-213ENST00000560277 526 ntTSL 49.89□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 UBAP2L-201ENST00000271877 3997 ntTSL 5 BASIC9.87□□□□□ -0.832e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 RTN2-214ENST00000593187 299 ntTSL 29.82□□□□□ -0.842e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ABCC2-202ENST00000370449 5312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.66□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZSWIM8-215ENST00000603195 674 ntTSL 29.65□□□□□ -0.862e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 UBAP2L-208ENST00000433615 1789 ntTSL 1 (best)9.62□□□□□ -0.872e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 AC007388.1-201ENST00000426083 1438 ntTSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.062e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ASPH-204ENST00000389204 1290 ntTSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.072e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 UBAP2L-203ENST00000361546 3864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.9□□□□□ -1.142e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZFAND2A-207ENST00000574135 433 ntTSL 37.88□□□□□ -1.152e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 METTL17-208ENST00000554354 249 ntTSL 57.67□□□□□ -1.182e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ARID1B-231ENST00000637887 1468 ntTSL 56.8□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.62□□□□□ -1.351e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 UBAP2L-218ENST00000493867 677 ntTSL 35.8□□□□□ -1.484e-8■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 FNBP1-208ENST00000482107 334 ntTSL 34.86□□□□□ -1.632e-6■■■■■ 32.7
PCBP1Q15365 ZNF385A-211ENST00000550779 2099 ntTSL 519.05■□□□□ 0.642e-6■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.572e-6■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.422e-6■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.192e-6■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.012e-6■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.931e-6■■■■■ 32.6
PCBP1Q15365 CYP27A1-205ENST00000494263 2566 ntTSL 217.59■□□□□ 0.411e-6■■■■■ 32.6
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