Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
COL19A1Q14993 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
COL19A1Q14993 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
COL19A1Q14993 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
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