Protein–RNA interactions for Protein: Q13886

KLF9, Krueppel-like factor 9, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLF9Q13886 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
KLF9Q13886 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
KLF9Q13886 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
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