Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
CUL4AQ13619 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CUL4AQ13619 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CUL4AQ13619 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
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