Protein–RNA interactions for Protein: Q13557

CAMK2D, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type II subunit delta, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMK2DQ13557 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
CAMK2DQ13557 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
CAMK2DQ13557 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
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