Protein–RNA interactions for Protein: Q12965

MYO1E, Unconventional myosin-Ie, humanhuman

Predictions only

Length 1,108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO1EQ12965 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MYO1EQ12965 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MYO1EQ12965 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MYO1EQ12965 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms