Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

Predictions only

Length 1,464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC37.35■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
GRIN2AQ12879 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.32■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC37.32■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC37.31■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC37.3■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC37.28■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC37.26■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
GRIN2AQ12879 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC37.25■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC37.22■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC37.2■■■■□ 3.55
GRIN2AQ12879 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC37.2■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC37.19■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC37.18■■■■□ 3.54
GRIN2AQ12879 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms