Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 ECM11YDR446W 909 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MXR1YER042W 555 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 BRR6YGL247W 594 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 SCM4YGR049W 564 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YGR293CYGR293C 462 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MTW1YAL034W-A 870 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 PRY2YKR013W 990 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YLR374CYLR374C 390 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YMR084WYMR084W 789 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YMR166CYMR166C 1107 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 DFR1YOR236W 636 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 PNT1YOR266W 1272 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YPR016W-AYPR016W-A 261 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YBR300CYBR300C 498 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 NOC4YPR144C 1659 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 ACF2YLR144C 2340 nt6.36□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 ECM38YLR299W 1983 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MST27YGL051W 705 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YGL242CYGL242C 546 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YIR020W-AYIR020W-A 243 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 REC107YJR021C 945 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MST28YAR033W 705 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 ADH1YOL086C 1047 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 SPR2YOR214C 711 nt6.35□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 ERG8YMR220W 1356 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 TYR1YBR166C 1359 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MRE11YMR224C 2079 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 HEL1YKR017C 1656 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 MEI4YER044C-A 1227 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YHR214WYHR214W 612 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YKL023WYKL023W 834 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 PET10YKR046C 852 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YAR066WYAR066W 612 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 YMR158C-AYMR158C-A 138 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 RNA1YMR235C 1224 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 DGA1YOR245C 1257 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 SPP381YBR152W 876 nt6.34□□□□□ -1.39
TY1A-DR3Q12441 GLR1YPL091W 1452 nt6.34□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 CYB2YML054C 1776 nt6.34□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 CST9YLR394W 1449 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 SPT15YER148W 723 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 RPL24AYGL031C 468 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YIL152WYIL152W 708 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 LDS1YAL018C 978 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YJU3YKL094W 942 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 DCN1YLR128W 810 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 VPS71YML041C 843 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 TOA1YOR194C 861 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 CST26YBR042C 1194 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 NRG2YBR066C 663 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 SLT2YHR030C 1455 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 TRP3YKL211C 1455 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 NSI1YDR026C 1713 nt6.33□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 PRP24YMR268C 1335 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YER165C-AYER165C-A 357 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 PEP8YJL053W 1140 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 CAR2YLR438W 1275 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YML131WYML131W 1098 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 FMP23YBR047W 528 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 RTC2YBR147W 891 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YFL040WYFL040W 1623 nt6.32□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 SIR1YKR101W 1965 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 ADY3YDL239C 2373 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 NOP16YER002W 696 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 PUP3YER094C 618 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 COS4YFL062W 1140 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YJR107WYJR107W 987 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 MRP51YPL118W 1035 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 RHO1YPR165W 630 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 TIM54YJL054W 1437 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 BDF2YDL070W 1917 nt6.31□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 CCT3YJL014W 1605 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YER133W-AYER133W-A 342 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YJL147CYJL147C 1149 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 MDE1YJR024C 735 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YLR444CYLR444C 303 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YMR158W-BYMR158W-B 321 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 GTO3YMR251W 1101 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YOR029WYOR029W 336 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 FYV12YOR183W 390 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YBR103C-AYBR103C-A 144 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YSY6YBR162W-A 198 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YCL049CYCL049C 939 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 TMA64YDR117C 1698 nt6.3□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 AVT4YNL101W 2142 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 CDC34YDR054C 888 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 FPR2YDR519W 408 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 PGD1YGL025C 1194 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 OST5YGL226C-A 261 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 CIA2YHR122W 696 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 THI73YLR004C 1572 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 SSO2YMR183C 888 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 FSH2YMR222C 672 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 FAA4YMR246W 2085 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 DBP9YLR276C 1785 nt6.29□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 VPS38YLR360W 1320 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YMD8YML038C 1329 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 GIT1YCR098C 1557 nt6.28□□□□□ -1.4
TY1A-DR3Q12441 YDL050CYDL050C 372 nt6.28□□□□□ -1.4
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