Protein–RNA interactions for Protein: P61011

SRP54, Signal recognition particle 54 kDa protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRP54P61011 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP54P61011 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP54P61011 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP54P61011 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP54P61011 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP54P61011 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SRP54P61011 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP54P61011 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP54P61011 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP54P61011 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP54P61011 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP54P61011 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP54P61011 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
SRP54P61011 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
SRP54P61011 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP54P61011 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP54P61011 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP54P61011 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SRP54P61011 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SRP54P61011 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP54P61011 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP54P61011 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP54P61011 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP54P61011 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP54P61011 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SRP54P61011 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP54P61011 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP54P61011 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP54P61011 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP54P61011 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SRP54P61011 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SRP54P61011 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP54P61011 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP54P61011 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP54P61011 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP54P61011 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP54P61011 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SRP54P61011 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP54P61011 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP54P61011 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP54P61011 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP54P61011 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP54P61011 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SRP54P61011 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP54P61011 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SRP54P61011 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.2 ms