Protein–RNA interactions for Protein: P53999

SUB1, Activated RNA polymerase II transcriptional coactivator p15, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUB1P53999 SNRPD3-202ENST00000402849 567 ntTSL 2 BASIC5.72□□□□□ -1.493e-21■■■■■ 35.8
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SUB1P53999 CLTA-208ENST00000493185 714 ntTSL 315.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 35.7
SUB1P53999 PPIP5K2-202ENST00000358359 5813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.24□□□□□ -1.258e-11■■■■■ 35.6
SUB1P53999 PPIP5K2-201ENST00000321521 15407 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.858e-11■■■■■ 35.6
SUB1P53999 PPIP5K2-217ENST00000627916 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.878e-11■■■■■ 35.6
SUB1P53999 PPIP5K2-203ENST00000414217 5842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.958e-11■■■■■ 35.6
SUB1P53999 PPIP5K2-210ENST00000509597 2799 ntTSL 21.36□□□□□ -2.198e-11■■■■■ 35.6
SUB1P53999 RNF114-203ENST00000622999 2438 ntTSL 216.89■□□□□ 0.291e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.287e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.197e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.187e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.17e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.091e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.047e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.021e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.067e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 EIF2B5-203ENST00000432982 597 ntTSL 514.66□□□□□ -0.061e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 MKRN1-206ENST00000471104 1053 ntTSL 514.58□□□□□ -0.081e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 GSN-201ENST00000373806 879 ntTSL 214.37□□□□□ -0.111e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.161e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.181e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.221e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 LGMN-217ENST00000557609 1832 ntTSL 513.46□□□□□ -0.251e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.271e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.321e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 MED16-212ENST00000607471 2004 ntTSL 1 (best)12.78□□□□□ -0.361e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.511e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.571e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 MED16-202ENST00000312090 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.85□□□□□ -0.671e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 MED16-204ENST00000395808 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.66□□□□□ -0.71e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 HAUS4-213ENST00000554446 1129 ntTSL 57.35□□□□□ -1.237e-7■■■■■ 35.6
SUB1P53999 WDR45-225ENST00000486337 422 ntTSL 56.77□□□□□ -1.331e-7■■■■■ 35.6
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SUB1P53999 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.811e-6■■■■■ 35.5
SUB1P53999 MRPL33-203ENST00000448427 527 ntTSL 47.3□□□□□ -1.241e-6■■■■■ 35.5
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SUB1P53999 CMSS1-201ENST00000421999 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.45□□□□□ -1.067e-8■■■■■ 35.5
SUB1P53999 CMSS1-209ENST00000497345 538 ntTSL 33.75□□□□□ -1.817e-8■■■■■ 35.5
SUB1P53999 CMSS1-207ENST00000494412 477 ntTSL 23.14□□□□□ -1.917e-8■■■■■ 35.5
SUB1P53999 SNRPB-203ENST00000474384 985 ntTSL 513.98□□□□□ -0.173e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.433e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 WDYHV1-201ENST00000287387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.76□□□□□ -1.012e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 WDYHV1-207ENST00000523551 853 ntTSL 36.6□□□□□ -1.352e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 WDYHV1-208ENST00000523984 1491 ntTSL 2 BASIC4.37□□□□□ -1.712e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 WDYHV1-203ENST00000518125 880 ntTSL 2 BASIC4.13□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 WDYHV1-209ENST00000524254 764 ntTSL 34.13□□□□□ -1.752e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DDX46-202ENST00000452510 5689 ntTSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.931e-6■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DDX46-207ENST00000507392 3565 ntTSL 26.7□□□□□ -1.341e-6■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DDX46-201ENST00000354283 3821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.39□□□□□ -1.391e-6■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DDX46-206ENST00000507053 530 ntTSL 43.15□□□□□ -1.911e-6■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DDX46-203ENST00000503946 4078 ntTSL 23.09□□□□□ -1.921e-6■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DDX46-205ENST00000506332 1589 ntTSL 22.37□□□□□ -2.031e-6■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.442e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DHRS11-210ENST00000611337 1341 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DHRS11-209ENST00000610443 4505 nt10.25□□□□□ -0.772e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DHRS11-214ENST00000617959 976 ntTSL 28.41□□□□□ -1.062e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 DHRS11-216ENST00000621871 883 ntTSL 35.12□□□□□ -1.592e-7■■■■■ 35.5
SUB1P53999 WDR1-202ENST00000382451 2722 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.334e-7■■■■■ 35.4
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