Protein–RNA interactions for Protein: P48553

TRAPPC10, Trafficking protein particle complex subunit 10, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10P48553 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRAPPC10P48553 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
TRAPPC10P48553 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
TRAPPC10P48553 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms