Protein–RNA interactions for Protein: P48506

GCLC, Glutamate--cysteine ligase catalytic subunit, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 637 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLCP48506 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
GCLCP48506 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCLCP48506 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCLCP48506 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCLCP48506 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCLCP48506 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
GCLCP48506 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
GCLCP48506 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
GCLCP48506 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
GCLCP48506 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
GCLCP48506 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCLCP48506 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
GCLCP48506 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCLCP48506 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
GCLCP48506 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCLCP48506 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCLCP48506 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCLCP48506 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
GCLCP48506 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
GCLCP48506 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
GCLCP48506 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms