Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
GTF2E1P29083 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
GTF2E1P29083 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
GTF2E1P29083 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms