Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GCAP28676 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GCAP28676 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCAP28676 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
GCAP28676 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GCAP28676 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GCAP28676 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GCAP28676 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GCAP28676 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GCAP28676 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GCAP28676 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
GCAP28676 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 249.5 ms