Protein–RNA interactions for Protein: P20827

EFNA1, Ephrin-A1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNA1P20827 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
EFNA1P20827 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
EFNA1P20827 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.4 ms