Protein–RNA interactions for Protein: O96020

CCNE2, G1/S-specific cyclin-E2, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE2O96020 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCNE2O96020 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CCNE2O96020 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCNE2O96020 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms