Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
UBXN7O94888 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
UBXN7O94888 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.7 ms